Game Boy Advance ima drugačiji utor za spremnik i koristi drugačiji procesor od originalnog Game Boya. Iako postoji nekoliko iznimaka (kao što je Game Boy Color, koja je kompatibilna s Game Boy Advance), Game Boy igre nisu kompatibilne s Game Boy Advance.
Međutim, možete igrati igre Game Boy i Game Boy Color na Game Boy Advance SP pomoću Game Boy Playera dodatak za Nintendo GameCube.